Salut Area !
Pour les modifications du nAiO en lui même, il n'y a aucun souci ni limitation à partir du moment que cela respecte les points importants de la license (ne pas s'attribuer la propriété des éléments déjà existant, ne pas annoncer que des éléments de ta création sont la propriété de l'équipe d'origine, ne pas se faire de fric avec ^^, et surtout si quelqu'un souhaite réutiliser ton code, qu'il puisse le faire sous les même conditions).
Pour les images, par contre c'est un peu différent. Comme dit dans le nAiO en lui même :
Les graphismes sont la propriété de Waz et/ou de l'équipe nAiO,
certaines illustrations sont la propriété d'Ankama Games.
La licence du nAiO ne s'applique pas sur ces éléments,
ne les utilisez pas sans accord préalable.
Certains éléments sont donc sujets au droit d'auteur. Mais au regard de ta question, ce n'est pas vraiment ce que tu souhaites faire, mais plutôt recréer un autre design sans réutiliser les éléments existants. Dans ce cas, fais toi plaisir !

Pour son intégration, pour le moment en tout cas, ce n'est pas vraiment facile de proposer aux gens un autre look, surtout que le positionnement des éléments est en dur dans le code. Mais remplacer les images du nAiO par d'autres de même taille, même nom et même format ne posera pas de problème. En attendant qu'un système de skin soit en place (désolé mais ça risque de prendre du temps), il va falloir que les dispositions soient les même qu'actuellement; je te rassure tout de même, la v3 du nAiO (qu'on appelle jAiO entre nous) qui fonctionnera en Java sera BEAUCOUP plus permissive en terme de "modularité" comme on dit : skins, audio, texte, disposition, fonctionnalités internes, traductions, etc...
Et enfin pour la distribution et la validation, je pourrai le mettre en ligne directement sur le site du nAiO si tu le souhaites, après qu'on en ait bien sûr inspecté le contenu (on ne peut pas se permettre de sortir des clous qu'Ankama nous a gentilement accordés). Et un module permettant éventuellement de passer d'un skin à l'autre sera une bonne idée (même si en ce moment, elle n'est pas totalement réalisable si on souhaite le faire proprement ^^).
A très bientôt !
PS: Ton message par rapport au site de Waz m'a bien fait rigoler ^^ Mais si tu veux vraiment connaitre ce qui traîne comme conneries dans ma tête, je te conseille plutôt ce
lien là 